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- 发布日期:2025-02-28 15:42 点击次数:88
在新一期《科学》期刊上,诺贝尔奖得主、好意思国华盛顿大学的大卫·贝克过甚团队发表了一篇冲破性商酌论文:他们初度操纵东谈主工智能(AI)时间,从零运行联想了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶。这项建设符号着酶工程畛域的一个热切里程碑,标明当今东谈主们有才气联想出具有自然酶活性的酶,何况这些东谈主工联想的酶还具备本体应用后劲。
传统措施在联想或者催化特定化学反馈的酶时,濒临雄伟挑战,主淌若因为将活性位点整合到事先存在的卵白质结构中时,持续会受到结构活泼性和活性位点预组织进程的法令,从而影响催化效果。尽管化学技巧不错在一定进程上克服这些问题,但领先策画联想的酶效果仍远低于自然酶。
然则,跟着深度学习时间的发展,为重新联想卵白质提供了可能,期货配资公司尤其是关于那些领有复杂活性位点的卵白质,如丝氨酸水解酶——这是已知最大的一类酶家眷之一。贝克团队这次引入了一种名为PLACER(卵白质—配体原子构象聚会再现)的新式机器学习网罗,该网罗通过分析卵白质骨架、氨基酸特点和联接分子的化学结构,来展望酶活性位点的精准原子罗列。
团队取舍了名为RFdiffusion的时间来创建含有复杂催化位点的卵白质,并使用PLACER评估这些卵白质的活性位点组织情况。最终,他们得手联想出了功能性丝氨酸水解酶,这些酶仅需最小化的活性位点轨范就能有用地催化酯水解反馈。此外,这种措施还在低通量筛选经过中发现了5种全新的酶折叠形貌,这些形貌不同于任何已知的自然丝氨酸水解酶中的折叠,极地面膨大了这一陈腐酶家眷的结构各样性。
这项商酌不仅代表了重新联想酶的要紧朝上,也为成立更高效的催化剂勾引了新路线,同期对意会和膨大酶的功能性具有热切好奇。
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